曲目　：

• 1. 東宝マーク

• 2. バース島消滅

• 3. メインタイトル・香港破壊

• 4. オキシジェンデストロイヤー

• 5. 海底トンネルの異変

• 6. ゴジラ,台湾沖を進む

• 7. 核爆発・地球炎上

• 8. オキシジェンデストロイヤーの恐怖

• 9. 水族館の悪夢

• 10. 微小生物判明

• 11. ゴジラ,沖縄沖を進む

• 12. 謎の生物の破壊

• 13. 特殊部隊出動

• 14. 謎の生物出現

• 15. 謎の生物焼却作戦

• 16. ゴジラ,原発に向う

• 17. スーパーX3出撃準備

• 18. スーパーX3の攻撃

• 19. 生きていたリトル

• 20. メルトダウン

• 21. メーサータンク超低温攻撃

• 22. デストロイア誕生

• 23. ジュニアを誘導

• 24. ジュニア初めての危機

• 25. ジュニアVSデストロイア

• 26. ゴジラとジュニアの再会

• 27. デストロイア巨大化

• 28. さらわれたジュニア

• 29. 瀕死のジュニア

• 30. ゴジラの決意

• 31. ゴジラVSデストロイア1

• 32. デストロイアの反撃

• 33. 悲しみの咆哮

• 34. ゴジラVSデストロイア2

• 35. メーサー部隊総攻撃

• 36. レクイエム

• 37. 新たなゴジラの誕生

• 38. エンディングタイトル